Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EHD2Q9NZN4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD2Q9NZN4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EHD2Q9NZN4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EHD2Q9NZN4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EHD2Q9NZN4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms