Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD3Q9NZN3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD3Q9NZN3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EHD3Q9NZN3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD3Q9NZN3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD3Q9NZN3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD3Q9NZN3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD3Q9NZN3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms