Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP53Q9NZM5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP53Q9NZM5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP53Q9NZM5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP53Q9NZM5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP53Q9NZM5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP53Q9NZM5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP53Q9NZM5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP53Q9NZM5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP53Q9NZM5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP53Q9NZM5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP53Q9NZM5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP53Q9NZM5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP53Q9NZM5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms