Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF2Q9NX18 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF2Q9NX18 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDHAF2Q9NX18 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF2Q9NX18 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF2Q9NX18 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF2Q9NX18 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF2Q9NX18 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF2Q9NX18 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF2Q9NX18 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF2Q9NX18 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF2Q9NX18 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF2Q9NX18 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF2Q9NX18 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms