Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MED17Q9NVC6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED17Q9NVC6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
MED17Q9NVC6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms