Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLSCR3Q9NRY6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLSCR3Q9NRY6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLSCR3Q9NRY6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms