Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL3Q9BXA9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL3Q9BXA9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL3Q9BXA9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL3Q9BXA9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL3Q9BXA9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL3Q9BXA9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL3Q9BXA9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SALL3Q9BXA9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SALL3Q9BXA9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SALL3Q9BXA9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SALL3Q9BXA9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SALL3Q9BXA9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SALL3Q9BXA9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SALL3Q9BXA9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SALL3Q9BXA9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SALL3Q9BXA9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SALL3Q9BXA9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SALL3Q9BXA9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms