Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM246Q9BRR3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM246Q9BRR3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM246Q9BRR3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms