Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LYSTQ99698 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYSTQ99698 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYSTQ99698 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LYSTQ99698 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms