Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC35A4Q96G79 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35A4Q96G79 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35A4Q96G79 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC35A4Q96G79 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms