Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPDL1Q96EA4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDL1Q96EA4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPDL1Q96EA4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDL1Q96EA4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms