Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDAC11Q96DB2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC11Q96DB2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC11Q96DB2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HDAC11Q96DB2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC11Q96DB2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms