Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC38A4Q969I6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A4Q969I6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A4Q969I6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A4Q969I6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms