Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX1Q92499 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX1Q92499 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX1Q92499 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX1Q92499 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX1Q92499 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX1Q92499 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX1Q92499 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX1Q92499 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX1Q92499 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX1Q92499 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX1Q92499 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX1Q92499 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX1Q92499 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms