Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC8Q8TC99 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC8Q8TC99 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNDC8Q8TC99 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNDC8Q8TC99 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms