Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET8

TRPV3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV3Q8NET8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV3Q8NET8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV3Q8NET8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV3Q8NET8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPV3Q8NET8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms