Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXR5

FAM178B, Protein FAM178B, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM178BQ8IXR5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM178BQ8IXR5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM178BQ8IXR5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM178BQ8IXR5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM178BQ8IXR5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM178BQ8IXR5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FAM178BQ8IXR5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM178BQ8IXR5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM178BQ8IXR5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM178BQ8IXR5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM178BQ8IXR5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM178BQ8IXR5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM178BQ8IXR5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM178BQ8IXR5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM178BQ8IXR5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms