Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TBC1D9Q6ZT07 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TBC1D9Q6ZT07 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TBC1D9Q6ZT07 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TBC1D9Q6ZT07 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TBC1D9Q6ZT07 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TBC1D9Q6ZT07 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TBC1D9Q6ZT07 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TBC1D9Q6ZT07 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TBC1D9Q6ZT07 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TBC1D9Q6ZT07 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TBC1D9Q6ZT07 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TBC1D9Q6ZT07 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TBC1D9Q6ZT07 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms