Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPB1

cDNA FLJ26142 fis, clone TST04526, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZPB1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q6ZPB1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q6ZPB1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q6ZPB1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q6ZPB1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q6ZPB1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q6ZPB1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q6ZPB1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q6ZPB1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q6ZPB1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q6ZPB1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q6ZPB1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q6ZPB1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q6ZPB1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q6ZPB1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q6ZPB1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms