Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN13Q6MZZ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN13Q6MZZ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN13Q6MZZ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN13Q6MZZ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN13Q6MZZ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN13Q6MZZ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN13Q6MZZ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN13Q6MZZ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN13Q6MZZ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms