Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1BQ3KR37 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRAMD1BQ3KR37 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1BQ3KR37 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRAMD1BQ3KR37 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD1BQ3KR37 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.2 ms