Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIL3Q16649 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIL3Q16649 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIL3Q16649 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIL3Q16649 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIL3Q16649 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIL3Q16649 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIL3Q16649 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIL3Q16649 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIL3Q16649 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NFIL3Q16649 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFIL3Q16649 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIL3Q16649 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIL3Q16649 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIL3Q16649 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIL3Q16649 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms