Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPTX1Q15818 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPTX1Q15818 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPTX1Q15818 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPTX1Q15818 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPTX1Q15818 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms