Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 TTL-203ENST00000476615 725 ntTSL 38.29□□□□□ -1.085e-21■■■■■ 68.7
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SF3B4Q15427 ZNF217-204ENST00000437222 746 ntTSL 29.06□□□□□ -0.963e-14■■■■■ 65.9
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SF3B4Q15427 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 65.8
SF3B4Q15427 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 65.8
SF3B4Q15427 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 314.31□□□□□ -0.124e-7■■■■■ 65.8
SF3B4Q15427 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 511.15□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 65.8
SF3B4Q15427 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 46.65□□□□□ -1.342e-12■■■■■ 65.7
SF3B4Q15427 FLCN-206ENST00000461699 243 ntTSL 36.44□□□□□ -1.384e-8■■■■■ 65.7
SF3B4Q15427 CAP1-219ENST00000494114 744 ntTSL 1 (best)4.47□□□□□ -1.692e-24■■■■■ 65.7
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SF3B4Q15427 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.065e-20■■■■■ 65.5
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SF3B4Q15427 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.544e-13■■■■■ 65.3
SF3B4Q15427 SRSF5-215ENST00000556587 1863 ntTSL 1 (best)11.46□□□□□ -0.584e-13■■■■■ 65.3
SF3B4Q15427 SRSF5-212ENST00000556184 2443 ntTSL 1 (best)10.53□□□□□ -0.724e-13■■■■■ 65.3
SF3B4Q15427 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.734e-13■■■■■ 65.3
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