RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557446.5

HIF1A-211, Transcript of hypoxia inducible factor 1 subunit alpha, human

TSL 5

Gene HIF1A, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HIF1A-211	ENST00000557446	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		48.2	■■■■■ 5.31
HIF1A-211	ENST00000557446	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		42.97	■■■■■ 4.47
HIF1A-211	ENST00000557446	ABCC9	O60706	1549 aa		42.02	■■■■■ 4.32
HIF1A-211	ENST00000557446	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		40.42	■■■■■ 4.06
HIF1A-211	ENST00000557446	NACAD	O15069	1562 aa		40.34	■■■■■ 4.05
HIF1A-211	ENST00000557446	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		40.21	■■■■■ 4.03
HIF1A-211	ENST00000557446	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	40.18	■■■■■ 4.02
HIF1A-211	ENST00000557446	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		40.06	■■■■■ 4
HIF1A-211	ENST00000557446	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		39.88	■■■■□ 3.97
HIF1A-211	ENST00000557446	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		39.6	■■■■□ 3.93
HIF1A-211	ENST00000557446	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		39.2	■■■■□ 3.87
HIF1A-211	ENST00000557446	SCRIB	Q14160	1630 aa		39.19	■■■■□ 3.86
HIF1A-211	ENST00000557446	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	39.18	■■■■□ 3.86
HIF1A-211	ENST00000557446	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		38.77	■■■■□ 3.8
HIF1A-211	ENST00000557446	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		38.52	■■■■□ 3.76
HIF1A-211	ENST00000557446	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	38.17	■■■■□ 3.7
HIF1A-211	ENST00000557446	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		38.04	■■■■□ 3.68
HIF1A-211	ENST00000557446	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		37.75	■■■■□ 3.63
HIF1A-211	ENST00000557446	SMARCA4	P51532	1647 aa		37.47	■■■■□ 3.59
HIF1A-211	ENST00000557446	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	37.39	■■■■□ 3.58
HIF1A-211	ENST00000557446	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		37.21	■■■■□ 3.55
HIF1A-211	ENST00000557446	SMARCA2	P51531	1590 aa		37.2	■■■■□ 3.55
HIF1A-211	ENST00000557446	NCAPD3	P42695	1498 aa		37.17	■■■■□ 3.54
HIF1A-211	ENST00000557446	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		37.17	■■■■□ 3.54
HIF1A-211	ENST00000557446	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		37.08	■■■■□ 3.53
HIF1A-211	ENST00000557446	HMGXB3	Q12766	1538 aa		37.06	■■■■□ 3.52
HIF1A-211	ENST00000557446	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	36.94	■■■■□ 3.5
HIF1A-211	ENST00000557446	WIZ	O95785	1651 aa		36.8	■■■■□ 3.48
HIF1A-211	ENST00000557446	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	36.68	■■■■□ 3.46
HIF1A-211	ENST00000557446	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	36.39	■■■■□ 3.42
HIF1A-211	ENST00000557446	NES	P48681	1621 aa		36.34	■■■■□ 3.41
HIF1A-211	ENST00000557446	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		36.27	■■■■□ 3.4
HIF1A-211	ENST00000557446	ERCC6	Q03468	1493 aa		36.23	■■■■□ 3.39
HIF1A-211	ENST00000557446	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		36.08	■■■■□ 3.37
HIF1A-211	ENST00000557446	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		36	■■■■□ 3.35
HIF1A-211	ENST00000557446	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		35.97	■■■■□ 3.35
HIF1A-211	ENST00000557446	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		35.91	■■■■□ 3.34
HIF1A-211	ENST00000557446	CFTR	P13569	1480 aa		35.88	■■■■□ 3.33
HIF1A-211	ENST00000557446	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	35.88	■■■■□ 3.33
HIF1A-211	ENST00000557446	CUX2	O14529	1486 aa		35.86	■■■■□ 3.33
HIF1A-211	ENST00000557446	PRDM2	Q13029	1718 aa		35.77	■■■■□ 3.32
HIF1A-211	ENST00000557446	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		35.72	■■■■□ 3.31
HIF1A-211	ENST00000557446	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		35.7	■■■■□ 3.31
HIF1A-211	ENST00000557446	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	35.68	■■■■□ 3.3
HIF1A-211	ENST00000557446	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		35.65	■■■■□ 3.3
HIF1A-211	ENST00000557446	WDR62	O43379	1518 aa		35.56	■■■■□ 3.28
HIF1A-211	ENST00000557446	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	35.37	■■■■□ 3.25
HIF1A-211	ENST00000557446	TOPBP1	Q92547	1522 aa		35.16	■■■■□ 3.22
HIF1A-211	ENST00000557446	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		35.13	■■■■□ 3.21
HIF1A-211	ENST00000557446	ABCC8	Q09428	1581 aa		35.12	■■■■□ 3.21
HIF1A-211	ENST00000557446	IFT140	Q96RY7	1462 aa		34.93	■■■■□ 3.18
HIF1A-211	ENST00000557446	CUX1	P39880	1505 aa		34.87	■■■■□ 3.17
HIF1A-211	ENST00000557446	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	34.84	■■■■□ 3.17
HIF1A-211	ENST00000557446	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	34.79	■■■■□ 3.16
HIF1A-211	ENST00000557446	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	34.78	■■■■□ 3.16
HIF1A-211	ENST00000557446	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		34.77	■■■■□ 3.16
HIF1A-211	ENST00000557446	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	34.72	■■■■□ 3.15
HIF1A-211	ENST00000557446	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.71	■■■■□ 3.15
HIF1A-211	ENST00000557446	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		34.68	■■■■□ 3.14
HIF1A-211	ENST00000557446	SOGA1	O94964	1423 aa		34.65	■■■■□ 3.14
HIF1A-211	ENST00000557446	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	34.61	■■■■□ 3.13
HIF1A-211	ENST00000557446	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		34.6	■■■■□ 3.13
HIF1A-211	ENST00000557446	TOP2B	Q02880	1626 aa		34.58	■■■■□ 3.13
HIF1A-211	ENST00000557446	SYNJ1	O43426	1573 aa		34.57	■■■■□ 3.13
HIF1A-211	ENST00000557446	WDR97	A6NE52	1622 aa		34.56	■■■■□ 3.12
HIF1A-211	ENST00000557446	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	34.55	■■■■□ 3.12	8e-7	■■□□□ 11.7
HIF1A-211	ENST00000557446	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	34.47	■■■■□ 3.11
HIF1A-211	ENST00000557446	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		34.41	■■■■□ 3.1
HIF1A-211	ENST00000557446	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		34.34	■■■■□ 3.09
HIF1A-211	ENST00000557446	PBRM1	Q86U86	1689 aa		34.33	■■■■□ 3.09
HIF1A-211	ENST00000557446	CHD1	O14646	1710 aa		34.31	■■■■□ 3.08
HIF1A-211	ENST00000557446	GRIN2B	Q13224	1484 aa		34.29	■■■■□ 3.08
HIF1A-211	ENST00000557446	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		34.28	■■■■□ 3.08
HIF1A-211	ENST00000557446	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		34.28	■■■■□ 3.08
HIF1A-211	ENST00000557446	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		34.27	■■■■□ 3.08
HIF1A-211	ENST00000557446	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	34.22	■■■■□ 3.07
HIF1A-211	ENST00000557446	FBLN2	P98095	1184 aa		34.12	■■■■□ 3.05
HIF1A-211	ENST00000557446	SYNJ2	O15056	1496 aa		34.07	■■■■□ 3.05
HIF1A-211	ENST00000557446	ADAMTS12	P58397	1594 aa		34.02	■■■■□ 3.04
HIF1A-211	ENST00000557446	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		34.01	■■■■□ 3.04
HIF1A-211	ENST00000557446	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	34.01	■■■■□ 3.03
HIF1A-211	ENST00000557446	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		33.89	■■■■□ 3.02
HIF1A-211	ENST00000557446	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		33.88	■■■■□ 3.01
HIF1A-211	ENST00000557446	KIF27	Q86VH2	1401 aa		33.87	■■■■□ 3.01
HIF1A-211	ENST00000557446	GRIN2A	Q12879	1464 aa		33.87	■■■■□ 3.01
HIF1A-211	ENST00000557446	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		33.86	■■■■□ 3.01
HIF1A-211	ENST00000557446	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		33.86	■■■■□ 3.01
HIF1A-211	ENST00000557446	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		33.86	■■■■□ 3.01
HIF1A-211	ENST00000557446	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.83	■■■■□ 3.01
HIF1A-211	ENST00000557446	CUL7	Q14999	1698 aa		33.74	■■■□□ 2.99
HIF1A-211	ENST00000557446	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.73	■■■□□ 2.99
HIF1A-211	ENST00000557446	NUP160	Q12769	1436 aa		33.7	■■■□□ 2.99
HIF1A-211	ENST00000557446	IGF1R	P08069	1367 aa		33.69	■■■□□ 2.98
HIF1A-211	ENST00000557446	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.68	■■■□□ 2.98
HIF1A-211	ENST00000557446	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		33.56	■■■□□ 2.96
HIF1A-211	ENST00000557446	ARAP1	Q96P48	1450 aa		33.55	■■■□□ 2.96
HIF1A-211	ENST00000557446	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.51	■■■□□ 2.96
HIF1A-211	ENST00000557446	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.5	■■■□□ 2.95
HIF1A-211	ENST00000557446	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		33.42	■■■□□ 2.94
HIF1A-211	ENST00000557446	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.41	■■■□□ 2.94

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