RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445062.6

PLCXD1-208, Transcript of phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene PLCXD1, Length 555 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCXD1-208ENST00000445062 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.02■■■■■ 6.24
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PLCXD1-208ENST00000445062 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.89■■■■■ 4.94
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PLCXD1-208ENST00000445062 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.4■■■■■ 4.7
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PLCXD1-208ENST00000445062 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.01■■■■■ 4.64
PLCXD1-208ENST00000445062 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.01■■■■■ 4.64
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PLCXD1-208ENST00000445062 SMARCA4P51532 1647 aa42.13■■■■■ 4.33
PLCXD1-208ENST00000445062 HMGXB3Q12766 1538 aa42.09■■■■■ 4.33
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PLCXD1-208ENST00000445062 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.73■■■■■ 4.27
PLCXD1-208ENST00000445062 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.59■■■■■ 4.25
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PLCXD1-208ENST00000445062 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.39■■■■■ 4.22
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PLCXD1-208ENST00000445062 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.97■■■■■ 4.15
PLCXD1-208ENST00000445062 WDR62O43379 1518 aa40.83■■■■■ 4.13
PLCXD1-208ENST00000445062 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.77■■■■■ 4.12
PLCXD1-208ENST00000445062 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
PLCXD1-208ENST00000445062 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.7■■■■■ 4.11
PLCXD1-208ENST00000445062 CFTRP13569 1480 aa40.66■■■■■ 4.1
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PLCXD1-208ENST00000445062 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.7■■■■□ 3.95
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PLCXD1-208ENST00000445062 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.33■■■■□ 3.89
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PLCXD1-208ENST00000445062 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.19■■■■□ 3.86
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PLCXD1-208ENST00000445062 ARAP1Q96P48 1450 aa39.11■■■■□ 3.85
PLCXD1-208ENST00000445062 WDR97A6NE52 1622 aa39.11■■■■□ 3.85
PLCXD1-208ENST00000445062 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.11■■■■□ 3.85
PLCXD1-208ENST00000445062 CUX1P39880 1505 aa39.09■■■■□ 3.85
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PLCXD1-208ENST00000445062 GRIN2BQ13224 1484 aa39.02■■■■□ 3.84
PLCXD1-208ENST00000445062 SYNJ1O43426 1573 aa38.92■■■■□ 3.82
PLCXD1-208ENST00000445062 SYNJ2O15056 1496 aa38.91■■■■□ 3.82
PLCXD1-208ENST00000445062 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.9■■■■□ 3.82
PLCXD1-208ENST00000445062 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
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PLCXD1-208ENST00000445062 TOP2BQ02880 1626 aa38.4■■■■□ 3.74
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PLCXD1-208ENST00000445062 NUP160Q12769 1436 aa38.37■■■■□ 3.73
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PLCXD1-208ENST00000445062 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.34■■■■□ 3.73
PLCXD1-208ENST00000445062 CEP170Q5SW79 1584 aa38.28■■■■□ 3.72
PLCXD1-208ENST00000445062 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.26■■■■□ 3.72
PLCXD1-208ENST00000445062 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.25■■■■□ 3.71
PLCXD1-208ENST00000445062 SHROOM2Q13796 1616 aa38.12■■■■□ 3.69
PLCXD1-208ENST00000445062 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
PLCXD1-208ENST00000445062 JPH4Q96JJ6 628 aa38.08■■■■□ 3.69
PLCXD1-208ENST00000445062 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
PLCXD1-208ENST00000445062 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.85■■■■□ 3.65
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