Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.616e-9■■■■■ 51
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PCBP1Q15365 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.992e-6■■■■■ 50.9
PCBP1Q15365 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.892e-6■■■■■ 50.9
PCBP1Q15365 MFSD12-207ENST00000588626 525 ntTSL 319.67■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 50.9
PCBP1Q15365 MFSD12-212ENST00000591878 557 ntTSL 517.83■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 50.9
PCBP1Q15365 MFSD12-205ENST00000585814 1002 ntTSL 317.13■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 50.9
PCBP1Q15365 MFSD12-213ENST00000592652 486 ntTSL 515.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 50.9
PCBP1Q15365 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.389e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.229e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CDC14B-209ENST00000474602 4960 ntTSL 1 (best)22.63■■□□□ 1.219e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.89e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.769e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.769e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.659e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.69e-10■■■■■ 50.5
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PCBP1Q15365 NDRG1-203ENST00000517331 584 ntTSL 517.59■□□□□ 0.419e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.319e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 NDRG1-211ENST00000519228 729 ntTSL 416.78■□□□□ 0.289e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.279e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.219e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.139e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 NDRG1-214ENST00000520230 582 ntTSL 414.92□□□□□ -0.029e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 NDRG1-206ENST00000518010 581 ntTSL 414.73□□□□□ -0.059e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PLD3-212ENST00000486134 327 ntTSL 214.69□□□□□ -0.062e-15■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.099e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 NDRG1-213ENST00000519580 550 ntTSL 514.44□□□□□ -0.19e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.149e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 NDRG1-221ENST00000522377 1103 ntTSL 513.87□□□□□ -0.199e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 FOXRED2-202ENST00000366463 2489 ntTSL 212.84□□□□□ -0.359e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CDC14B-204ENST00000412285 5271 ntTSL 1 (best)9.45□□□□□ -0.99e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.769e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.362e-9■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-9■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CABLES1-210ENST00000585061 584 ntTSL 514.51□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CABLES1-205ENST00000579963 2074 ntTSL 211.29□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CABLES1-203ENST00000420687 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CABLES1-202ENST00000400473 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CELSR2-204ENST00000498157 3680 ntTSL 212.4□□□□□ -0.431e-10■■■■■ 50.2
PCBP1Q15365 CELSR2-203ENST00000489018 2958 ntTSL 512.18□□□□□ -0.461e-10■■■■■ 50.2
PCBP1Q15365 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.511e-10■■■■■ 50.2
PCBP1Q15365 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.465e-8■■■■■ 50
PCBP1Q15365 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 514.51□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 50
PCBP1Q15365 ERI3-202ENST00000372259 1332 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.625e-8■■■■■ 50
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PCBP1Q15365 FMC1-204ENST00000482181 386 ntTSL 214.22□□□□□ -0.131e-22■■■■■ 50
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PCBP1Q15365 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 49.8
PCBP1Q15365 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 49.8
PCBP1Q15365 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 49.8
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PCBP1Q15365 APOC1-206ENST00000590334 508 ntTSL 513.31□□□□□ -0.285e-16■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.625e-16■■■■■ 49.4
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PCBP1Q15365 APOC1-207ENST00000592176 514 ntTSL 510.21□□□□□ -0.775e-16■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.955e-16■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 CTDNEP1-206ENST00000571409 741 ntTSL 533.71■■■□□ 2.993e-14■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.397e-11■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.747e-11■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.73e-14■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 CTDNEP1-211ENST00000575783 876 ntTSL 518.09■□□□□ 0.493e-14■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.651e-9■■■■■ 49.3
PCBP1Q15365 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 519.46■□□□□ 0.711e-9■■■■■ 49.3
PCBP1Q15365 NLGN2-203ENST00000572893 305 ntTSL 327.3■■□□□ 1.964e-8■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.474e-8■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 PPP2R5E-207ENST00000556878 3371 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 510.4□□□□□ -0.747e-11■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 57.59□□□□□ -1.197e-11■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 54.62□□□□□ -1.677e-11■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 54.4□□□□□ -1.77e-11■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.117e-11■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 49.1
PCBP1Q15365 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -12e-7■■■■■ 49.1
PCBP1Q15365 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.17e-9■■■■■ 49
PCBP1Q15365 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.947e-9■■■■■ 49
PCBP1Q15365 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.887e-9■■■■■ 49
PCBP1Q15365 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.847e-9■■■■■ 49
PCBP1Q15365 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.467e-9■■■■■ 49
PCBP1Q15365 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.039e-7■■■■■ 49
PCBP1Q15365 ABCC6-202ENST00000456970 4137 ntTSL 214.25□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 49
PCBP1Q15365 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.189e-7■■■■■ 49
PCBP1Q15365 FARP2-219ENST00000486736 578 ntTSL 314.59□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 48.7
PCBP1Q15365 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 48.7
PCBP1Q15365 FARP2-220ENST00000491425 484 ntTSL 313.18□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 48.7
PCBP1Q15365 U2AF2-203ENST00000587196 778 ntTSL 315.82■□□□□ 0.129e-10■■■■■ 48.7
PCBP1Q15365 PXN-203ENST00000323871 5457 ntTSL 218.4■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 AC018552.2-201ENST00000563062 804 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 48.6
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