RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 NISCHQ9Y2I1 1504 aa74.92■■■■■ 9.58
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SMARCA2P51531 1590 aa58.05■■■■■ 6.88
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CTDNEP1-206ENST00000571409 CEP164Q9UPV0 1460 aa55.86■■■■■ 6.53
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CTDNEP1-206ENST00000571409 GRIN2BQ13224 1484 aa53.58■■■■■ 6.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa53.57■■■■■ 6.17
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CTDNEP1-206ENST00000571409 TOP2BQ02880 1626 aa53.56■■■■■ 6.16
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SYNJ1O43426 1573 aa53.53■■■■■ 6.16
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa53.45■■■■■ 6.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 ARHGEF11O15085 1522 aa53.42■■■■■ 6.14
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CTDNEP1-206ENST00000571409 CEP170Q5SW79 1584 aa52.69■■■■■ 6.03
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ERCC6L2Q5T890 1561 aa52.39■■■■■ 5.98
CTDNEP1-206ENST00000571409 SHROOM2Q13796 1616 aa52.39■■■■■ 5.98
CTDNEP1-206ENST00000571409 IGF1RP08069 1367 aa52.38■■■■■ 5.98
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CTDNEP1-206ENST00000571409 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa52.23■■■■■ 5.95
CTDNEP1-206ENST00000571409 TRHP20396 242 aaPredicted RBP52.15■■■■■ 5.94
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