Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.416e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CEP68-203ENST00000475851 550 ntTSL 417.45■□□□□ 0.386e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TMEM222-202ENST00000464720 1665 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.356e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 WDR90-213ENST00000548859 512 ntTSL 417.01■□□□□ 0.316e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 PKN3-203ENST00000485301 752 ntTSL 516.61■□□□□ 0.256e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.216e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 NUP93-221ENST00000569863 630 ntTSL 416.13■□□□□ 0.176e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.156e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.146e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 IRAK1-212ENST00000467236 434 ntTSL 215.81■□□□□ 0.126e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TMEM222-208ENST00000486082 994 ntTSL 315.76■□□□□ 0.116e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 IRAK1-209ENST00000444254 783 ntTSL 515.73■□□□□ 0.116e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CHFR-223ENST00000544268 2412 ntTSL 515.63■□□□□ 0.096e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CHFR-202ENST00000315585 2446 ntTSL 215.45■□□□□ 0.066e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 NUP93-208ENST00000563858 797 ntTSL 515.42■□□□□ 0.066e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 SGSM3-207ENST00000469719 1029 ntTSL 515.08■□□□□ 06e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 PDXK-208ENST00000461123 637 ntTSL 315.07■□□□□ 06e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 SGSM3-202ENST00000417424 666 ntTSL 514.72□□□□□ -0.056e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.076e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 SGSM3-205ENST00000462457 881 ntTSL 514.32□□□□□ -0.126e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 B4GALT3-206ENST00000467863 843 ntTSL 514.29□□□□□ -0.126e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 B4GALT3-208ENST00000482288 680 ntTSL 314.29□□□□□ -0.126e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.146e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 B4GALT3-203ENST00000460415 557 ntTSL 313.56□□□□□ -0.246e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TMEM222-207ENST00000478104 986 ntTSL 313.42□□□□□ -0.266e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.336e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CHFR-216ENST00000538235 687 ntTSL 312.84□□□□□ -0.356e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CHFR-210ENST00000535527 746 ntTSL 312.84□□□□□ -0.356e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.46e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.46e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 NUP93-220ENST00000569842 2834 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.456e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TRIO-205ENST00000503399 553 ntTSL 212□□□□□ -0.496e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.56e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 NUP93-211ENST00000566315 589 ntTSL 411.63□□□□□ -0.556e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.626e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ZNRD1-206ENST00000471008 3672 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.676e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ZNRD1-205ENST00000463141 571 ntTSL 210.85□□□□□ -0.676e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 AC114490.2-201ENST00000487874 3099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.736e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ZNRD1-202ENST00000359374 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.776e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CREBBP-203ENST00000570939 3316 ntTSL 59.42□□□□□ -0.96e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.956e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 RRP7BP-202ENST00000421116 729 ntTSL 39.09□□□□□ -0.956e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 PRKCSH-215ENST00000592435 358 ntTSL 59.08□□□□□ -0.966e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 NUP93-210ENST00000564887 2875 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.976e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TRIO-201ENST00000344135 4065 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -16e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TMEM222-209ENST00000498220 679 ntTSL 38.72□□□□□ -1.016e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CKAP5-204ENST00000525896 832 ntTSL 27.94□□□□□ -1.146e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ZMYM6-205ENST00000460607 2471 ntTSL 27.88□□□□□ -1.156e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.196e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 NUP93-215ENST00000567641 604 ntTSL 47.53□□□□□ -1.26e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.336e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ZMYM6-209ENST00000493328 6241 ntTSL 1 (best)6.53□□□□□ -1.366e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ZMYM6-207ENST00000471566 686 ntTSL 36.18□□□□□ -1.426e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.516e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CKAP5-212ENST00000533413 3084 ntTSL 1 (best)5.49□□□□□ -1.536e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.566e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.626e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.626e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.756e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.86e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.026e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 ALDOA-217ENST00000566130 801 ntTSL 213.14□□□□□ -0.316e-14■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 INTS11-227ENST00000525603 738 ntTSL 313.37□□□□□ -0.272e-14■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 HSPE1-207ENST00000495200 537 ntTSL 317.19■□□□□ 0.349e-7■■■■■ 67.9
EFTUD2Q15029 HSPE1-206ENST00000473395 569 ntTSL 212.37□□□□□ -0.439e-7■■■■■ 67.9
EFTUD2Q15029 RAB4A-203ENST00000481981 531 ntTSL 220.51■□□□□ 0.879e-25■■■■■ 67.4
EFTUD2Q15029 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.739e-25■■■■■ 67.4
EFTUD2Q15029 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.79e-25■■■■■ 67.4
EFTUD2Q15029 RAB4A-202ENST00000473894 708 ntTSL 317.39■□□□□ 0.379e-25■■■■■ 67.4
EFTUD2Q15029 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 67.2
EFTUD2Q15029 RPS4X-202ENST00000373626 594 ntTSL 38.49□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 67.2
EFTUD2Q15029 RPS4X-204ENST00000486733 1820 ntTSL 58.11□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 67.2
EFTUD2Q15029 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.148e-13■■■■■ 67
EFTUD2Q15029 REXO1-207ENST00000590936 1271 ntTSL 514.25□□□□□ -0.138e-13■■■■■ 67
EFTUD2Q15029 REXO1-206ENST00000588743 369 ntTSL 314.25□□□□□ -0.138e-13■■■■■ 67
EFTUD2Q15029 SGSM3-204ENST00000457767 1086 ntTSL 213□□□□□ -0.338e-13■■■■■ 67
EFTUD2Q15029 REXO1-203ENST00000586343 718 ntTSL 512.77□□□□□ -0.378e-13■■■■■ 67
EFTUD2Q15029 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.478e-12■■■■■ 66.9
EFTUD2Q15029 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.468e-12■■■■■ 66.9
EFTUD2Q15029 CFL1-205ENST00000526975 567 ntTSL 317.53■□□□□ 0.48e-12■■■■■ 66.9
EFTUD2Q15029 CFL1-210ENST00000530945 1509 ntTSL 216.96■□□□□ 0.38e-12■■■■■ 66.9
EFTUD2Q15029 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.178e-12■■■■■ 66.9
EFTUD2Q15029 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.338e-12■■■■■ 66.9
EFTUD2Q15029 CFL1-213ENST00000532134 855 ntTSL 512.07□□□□□ -0.488e-12■■■■■ 66.9
EFTUD2Q15029 CFL1-207ENST00000527752 766 ntTSL 510.83□□□□□ -0.688e-12■■■■■ 66.9
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-206ENST00000535038 578 ntTSL 46.1□□□□□ -1.439e-7■■■■■ 66.7
EFTUD2Q15029 FTSJ1-209ENST00000487353 838 ntTSL 516.94■□□□□ 0.34e-11■■■■■ 66.6
EFTUD2Q15029 FTSJ1-208ENST00000485486 547 ntTSL 315.49■□□□□ 0.074e-11■■■■■ 66.6
EFTUD2Q15029 TRIM28-208ENST00000597172 577 ntTSL 29.37□□□□□ -0.914e-22■■■■■ 66.6
EFTUD2Q15029 AP1M1-215ENST00000592703 583 ntTSL 212.28□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 66.5
EFTUD2Q15029 SLC3A2-220ENST00000542922 2174 ntTSL 214.36□□□□□ -0.112e-14■■■■■ 66.3
EFTUD2Q15029 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.274e-8■■■■■ 66.3
EFTUD2Q15029 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.764e-8■■■■■ 66.3
EFTUD2Q15029 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.762e-7■■■■■ 66.3
EFTUD2Q15029 CRIP1-206ENST00000496700 2241 ntTSL 224.06■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 66.3
EFTUD2Q15029 CRIP1-204ENST00000460900 1443 ntTSL 221.87■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 66.3
EFTUD2Q15029 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 66.3
EFTUD2Q15029 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 66.3
EFTUD2Q15029 AL928654.4-201ENST00000477724 678 ntAPPRIS P5 TSL 413.52□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 66.3
EFTUD2Q15029 CENPF-205ENST00000495259 345 ntTSL 313.14□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 66.2
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 2817.6 ms