RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481981.1

RAB4A-203, Transcript of RAB4A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB4A, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4A-203ENST00000481981 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.58■■■■■ 6.49
RAB4A-203ENST00000481981 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.95■■■■■ 5.59
RAB4A-203ENST00000481981 ABCC9O60706 1549 aa49.89■■■■■ 5.58
RAB4A-203ENST00000481981 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.5■■■■■ 5.19
RAB4A-203ENST00000481981 NACADO15069 1562 aa47.15■■■■■ 5.14
RAB4A-203ENST00000481981 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.84■■■■■ 5.09
RAB4A-203ENST00000481981 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.71■■■■■ 5.07
RAB4A-203ENST00000481981 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.51■■■■■ 5.04
RAB4A-203ENST00000481981 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.49■■■■■ 5.03
RAB4A-203ENST00000481981 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.39■■■■■ 5.02
RAB4A-203ENST00000481981 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.13■■■■■ 4.97
RAB4A-203ENST00000481981 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
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RAB4A-203ENST00000481981 SCRIBQ14160 1630 aa45.52■■■■■ 4.88
RAB4A-203ENST00000481981 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.49■■■■■ 4.87
RAB4A-203ENST00000481981 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.09■■■■■ 4.81
RAB4A-203ENST00000481981 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
RAB4A-203ENST00000481981 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.92■■■■■ 4.78
RAB4A-203ENST00000481981 NCAPD3P42695 1498 aa43.5■■■■■ 4.55
RAB4A-203ENST00000481981 SMARCA4P51532 1647 aa43.4■■■■■ 4.54
RAB4A-203ENST00000481981 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.39■■■■■ 4.54
RAB4A-203ENST00000481981 SMARCA2P51531 1590 aa43.3■■■■■ 4.52
RAB4A-203ENST00000481981 HMGXB3Q12766 1538 aa43.24■■■■■ 4.51
RAB4A-203ENST00000481981 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
RAB4A-203ENST00000481981 ERCC6Q03468 1493 aa43.08■■■■■ 4.49
RAB4A-203ENST00000481981 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
RAB4A-203ENST00000481981 CUX2O14529 1486 aa42.99■■■■■ 4.47
RAB4A-203ENST00000481981 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.95■■■■■ 4.47
RAB4A-203ENST00000481981 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.87■■■■■ 4.45
RAB4A-203ENST00000481981 NESP48681 1621 aa42.86■■■■■ 4.45
RAB4A-203ENST00000481981 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.85■■■■■ 4.45
RAB4A-203ENST00000481981 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.57■■■■■ 4.41
RAB4A-203ENST00000481981 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
RAB4A-203ENST00000481981 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.38■■■■■ 4.37
RAB4A-203ENST00000481981 WIZO95785 1651 aa42.36■■■■■ 4.37
RAB4A-203ENST00000481981 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.28■■■■■ 4.36
RAB4A-203ENST00000481981 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.17■■■■■ 4.34
RAB4A-203ENST00000481981 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.96■■■■■ 4.31
RAB4A-203ENST00000481981 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
RAB4A-203ENST00000481981 WDR62O43379 1518 aa41.86■■■■■ 4.29
RAB4A-203ENST00000481981 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
RAB4A-203ENST00000481981 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.8■■■■■ 4.28
RAB4A-203ENST00000481981 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.73■■■■■ 4.27
RAB4A-203ENST00000481981 CFTRP13569 1480 aa41.72■■■■■ 4.27
RAB4A-203ENST00000481981 PRDM2Q13029 1718 aa41.43■■■■■ 4.22
RAB4A-203ENST00000481981 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
RAB4A-203ENST00000481981 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.3■■■■■ 4.2
RAB4A-203ENST00000481981 TRIM41Q8WV44 630 aa41.04■■■■■ 4.16
RAB4A-203ENST00000481981 TOPBP1Q92547 1522 aa40.96■■■■■ 4.15
RAB4A-203ENST00000481981 OSCARQ8IYS5 282 aa40.94■■■■■ 4.14
RAB4A-203ENST00000481981 IFT140Q96RY7 1462 aa40.94■■■■■ 4.14
RAB4A-203ENST00000481981 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.14
RAB4A-203ENST00000481981 ABCC8Q09428 1581 aa40.83■■■■■ 4.13
RAB4A-203ENST00000481981 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.83■■■■■ 4.13
RAB4A-203ENST00000481981 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
RAB4A-203ENST00000481981 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
RAB4A-203ENST00000481981 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.54■■■■■ 4.08
RAB4A-203ENST00000481981 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.54■■■■■ 4.08
RAB4A-203ENST00000481981 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.54■■■■■ 4.08
RAB4A-203ENST00000481981 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
RAB4A-203ENST00000481981 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.49■■■■■ 4.075e-10■■■■■ 39.2
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RAB4A-203ENST00000481981 ARHGEF11O15085 1522 aa40.38■■■■■ 4.06
RAB4A-203ENST00000481981 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.38■■■■■ 4.05
RAB4A-203ENST00000481981 SOGA1O94964 1423 aa40.31■■■■■ 4.04
RAB4A-203ENST00000481981 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.29■■■■■ 4.04
RAB4A-203ENST00000481981 CUX1P39880 1505 aa40.26■■■■■ 4.04
RAB4A-203ENST00000481981 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
RAB4A-203ENST00000481981 FBLN2P98095 1184 aa40.21■■■■■ 4.03
RAB4A-203ENST00000481981 WDR97A6NE52 1622 aa40.2■■■■■ 4.03
RAB4A-203ENST00000481981 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.13■■■■■ 4.01
RAB4A-203ENST00000481981 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
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RAB4A-203ENST00000481981 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40■■■■□ 3.99
RAB4A-203ENST00000481981 ARAP1Q96P48 1450 aa40■■■■□ 3.99
RAB4A-203ENST00000481981 GRIN2BQ13224 1484 aa39.99■■■■□ 3.99
RAB4A-203ENST00000481981 PBRM1Q86U86 1689 aa39.93■■■■□ 3.98
RAB4A-203ENST00000481981 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.93■■■■□ 3.98
RAB4A-203ENST00000481981 SYNJ1O43426 1573 aa39.9■■■■□ 3.98
RAB4A-203ENST00000481981 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
RAB4A-203ENST00000481981 SYNJ2O15056 1496 aa39.87■■■■□ 3.97
RAB4A-203ENST00000481981 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.85■■■■□ 3.97
RAB4A-203ENST00000481981 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.82■■■■□ 3.97
RAB4A-203ENST00000481981 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.81■■■■□ 3.96
RAB4A-203ENST00000481981 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.65■■■■□ 3.94
RAB4A-203ENST00000481981 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.64■■■■□ 3.94
RAB4A-203ENST00000481981 TOP2BQ02880 1626 aa39.63■■■■□ 3.93
RAB4A-203ENST00000481981 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
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RAB4A-203ENST00000481981 GRIN2AQ12879 1464 aa39.49■■■■□ 3.91
RAB4A-203ENST00000481981 CEP170Q5SW79 1584 aa39.38■■■■□ 3.9
RAB4A-203ENST00000481981 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.34■■■■□ 3.89
RAB4A-203ENST00000481981 NUP160Q12769 1436 aa39.34■■■■□ 3.89
RAB4A-203ENST00000481981 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.33■■■■□ 3.89
RAB4A-203ENST00000481981 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.31■■■■□ 3.88
RAB4A-203ENST00000481981 SHROOM2Q13796 1616 aa39.22■■■■□ 3.87
RAB4A-203ENST00000481981 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.97■■■■□ 3.83
RAB4A-203ENST00000481981 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
RAB4A-203ENST00000481981 JPH4Q96JJ6 628 aa38.87■■■■□ 3.81
RAB4A-203ENST00000481981 CUL7Q14999 1698 aa38.81■■■■□ 3.8
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