Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.023e-175■■■■■ 568
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EFTUD2Q15029 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.659e-37■■■■■ 203.2
EFTUD2Q15029 KHSRP-208ENST00000597656 328 ntTSL 58.18□□□□□ -1.14e-39■■■■■ 201
EFTUD2Q15029 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.261e-34■■■■■ 199.2
EFTUD2Q15029 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.687e-8■■■■■ 189.2
EFTUD2Q15029 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.327e-8■■■■■ 189.2
EFTUD2Q15029 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 45.17□□□□□ -1.587e-8■■■■■ 189.2
EFTUD2Q15029 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.048e-28■■■■■ 188.4
EFTUD2Q15029 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.165e-27■■■■■ 183.1
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-204ENST00000554401 1710 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.013e-22■■■■■ 176.9
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-205ENST00000555662 429 ntTSL 24.6□□□□□ -1.673e-22■■■■■ 176.9
EFTUD2Q15029 CSAG1-201ENST00000361211 630 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.112e-18■■■■■ 149.2
EFTUD2Q15029 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.112e-18■■■■■ 149.2
EFTUD2Q15029 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-18■■■■■ 149.2
EFTUD2Q15029 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.282e-18■■■■■ 149.2
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EFTUD2Q15029 FIGNL1-205ENST00000422854 582 ntTSL 414.76□□□□□ -0.058e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-204ENST00000420829 582 ntTSL 413.75□□□□□ -0.218e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-208ENST00000436590 559 ntTSL 410.74□□□□□ -0.698e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-210ENST00000448788 572 ntTSL 49.9□□□□□ -0.828e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-206ENST00000433017 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.888e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-211ENST00000611938 3543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.938e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-214ENST00000617389 3259 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.958e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.238e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.798e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.818e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.028e-26■■■■■ 133.2
EFTUD2Q15029 YTHDC1-206ENST00000510746 515 ntTSL 423.12■■□□□ 1.291e-23■■■■■ 131.2
EFTUD2Q15029 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 38.21□□□□□ -1.12e-18■■■■■ 125.6
EFTUD2Q15029 FBL-205ENST00000595545 896 ntTSL 27.76□□□□□ -1.172e-18■■■■■ 125.6
EFTUD2Q15029 RNF5-204ENST00000487940 357 ntTSL 214.85□□□□□ -0.037e-14■■■■■ 125
EFTUD2Q15029 RPL38-205ENST00000530646 2450 ntTSL 1 (best)19.06■□□□□ 0.645e-57■■■■■ 123.9
EFTUD2Q15029 RPL38-203ENST00000528433 169 ntTSL 512.6□□□□□ -0.395e-57■■■■■ 123.9
EFTUD2Q15029 RPL38-204ENST00000529123 576 ntTSL 29.82□□□□□ -0.845e-57■■■■■ 123.9
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-14■■■■■ 119.1
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-14■■■■■ 119.1
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-203ENST00000553585 581 ntTSL 35.22□□□□□ -1.572e-14■■■■■ 119.1
EFTUD2Q15029 SKIV2L-211ENST00000485349 734 ntTSL 215.68■□□□□ 0.14e-85■■■■■ 118.2
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EFTUD2Q15029 ABCC1-205ENST00000574224 1543 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.416e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-205ENST00000599530 730 ntTSL 311.58□□□□□ -0.566e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-207ENST00000600738 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.826e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-203ENST00000596690 564 ntTSL 49.75□□□□□ -0.856e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.956e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-202ENST00000595418 546 ntTSL 59□□□□□ -0.976e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-204ENST00000597882 561 ntTSL 48.15□□□□□ -1.16e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 RPS6-205ENST00000498815 480 ntTSL 23.73□□□□□ -1.819e-24■■■■■ 114.9
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EFTUD2Q15029 KHSRP-203ENST00000594745 379 ntTSL 313.35□□□□□ -0.278e-19■■■■■ 114.4
EFTUD2Q15029 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.517e-13■■■■■ 113.9
EFTUD2Q15029 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.637e-13■■■■■ 113.9
EFTUD2Q15029 RPL38-207ENST00000534490 429 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.817e-13■■■■■ 113.9
EFTUD2Q15029 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.827e-13■■■■■ 113.9
EFTUD2Q15029 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.717e-13■■■■■ 113.9
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EFTUD2Q15029 AKR1A1-206ENST00000475919 630 ntTSL 210.11□□□□□ -0.794e-21■■■■■ 109.6
EFTUD2Q15029 SLC3A2-214ENST00000539507 534 ntTSL 36.17□□□□□ -1.424e-14■■■■■ 103.4
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EFTUD2Q15029 ABCF3-216ENST00000485921 813 ntTSL 223.07■■□□□ 1.281e-14■■■■■ 99.4
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EFTUD2Q15029 ABCF3-204ENST00000463685 661 ntTSL 214.96□□□□□ -0.011e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-213ENST00000540241 608 ntTSL 312.7□□□□□ -0.381e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 SFXN2-211ENST00000602785 607 ntTSL 512.69□□□□□ -0.381e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 ABCF3-215ENST00000481116 568 ntTSL 412.25□□□□□ -0.451e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 ABCF3-212ENST00000478288 754 ntTSL 312.08□□□□□ -0.481e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 SFXN2-209ENST00000602670 574 ntTSL 411.58□□□□□ -0.561e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 ABCF3-205ENST00000466416 554 ntTSL 48.4□□□□□ -1.061e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.87e-18■■■■■ 98.9
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EFTUD2Q15029 SNRPA-205ENST00000598923 952 ntTSL 217.74■□□□□ 0.437e-18■■■■■ 98.9
EFTUD2Q15029 SNRPA-210ENST00000601393 969 ntTSL 316.08■□□□□ 0.167e-18■■■■■ 98.9
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EFTUD2Q15029 TRIM28-206ENST00000595974 665 ntTSL 315.42■□□□□ 0.061e-13■■■■■ 97.8
EFTUD2Q15029 ABCC10-209ENST00000502549 478 ntTSL 316.29■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 96.8
EFTUD2Q15029 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.021e-13■■■■■ 96.8
EFTUD2Q15029 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.462e-13■■■■■ 96.3
EFTUD2Q15029 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.728e-9■■■■■ 96
EFTUD2Q15029 RPS18-235ENST00000479802 413 ntTSL 210.93□□□□□ -0.664e-24■■■■■ 95
EFTUD2Q15029 RPS18-231ENST00000472218 1109 ntTSL 210.82□□□□□ -0.684e-24■■■■■ 95
EFTUD2Q15029 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 94.9
EFTUD2Q15029 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.88e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.388e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.278e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 TUSC2-205ENST00000462137 834 ntTSL 321.18■□□□□ 0.988e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ELL3-202ENST00000433927 792 ntTSL 518.88■□□□□ 0.618e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ELL3-208ENST00000497700 574 ntTSL 317.4■□□□□ 0.388e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 HYAL2-206ENST00000428028 571 ntTSL 316.62■□□□□ 0.258e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.238e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.188e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ATG16L1-207ENST00000417017 684 ntTSL 515.76■□□□□ 0.118e-14■■■■■ 94.2
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EFTUD2Q15029 ATG16L1-210ENST00000444735 691 ntTSL 515.25■□□□□ 0.038e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ATG16L1-216ENST00000485623 568 ntTSL 214.09□□□□□ -0.158e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 HYAL2-210ENST00000481597 1513 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.218e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ELL3-207ENST00000497530 582 ntTSL 313.07□□□□□ -0.328e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ELL3-204ENST00000476335 452 ntTSL 212.18□□□□□ -0.468e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 AC018512.1-201ENST00000417761 2326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.558e-14■■■■■ 94.2
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