Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.023e-175■■■■■ 568
EFTUD2Q15029 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.452e-32■■■■■ 219.8
EFTUD2Q15029 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.659e-37■■■■■ 203.2
EFTUD2Q15029 KHSRP-208ENST00000597656 328 ntTSL 58.18□□□□□ -1.14e-39■■■■■ 201
EFTUD2Q15029 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.261e-34■■■■■ 199.2
EFTUD2Q15029 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.687e-8■■■■■ 189.2
EFTUD2Q15029 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.327e-8■■■■■ 189.2
EFTUD2Q15029 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 45.17□□□□□ -1.587e-8■■■■■ 189.2
EFTUD2Q15029 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.048e-28■■■■■ 188.4
EFTUD2Q15029 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.165e-27■■■■■ 183.1
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-204ENST00000554401 1710 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.013e-22■■■■■ 176.9
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-205ENST00000555662 429 ntTSL 24.6□□□□□ -1.673e-22■■■■■ 176.9
EFTUD2Q15029 CSAG1-201ENST00000361211 630 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.112e-18■■■■■ 149.2
EFTUD2Q15029 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.112e-18■■■■■ 149.2
EFTUD2Q15029 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-18■■■■■ 149.2
EFTUD2Q15029 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.282e-18■■■■■ 149.2
EFTUD2Q15029 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.218e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-205ENST00000422854 582 ntTSL 414.76□□□□□ -0.058e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-204ENST00000420829 582 ntTSL 413.75□□□□□ -0.218e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-208ENST00000436590 559 ntTSL 410.74□□□□□ -0.698e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-210ENST00000448788 572 ntTSL 49.9□□□□□ -0.828e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-206ENST00000433017 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.888e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-211ENST00000611938 3543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.938e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-214ENST00000617389 3259 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.958e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.238e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.798e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.818e-21■■■■■ 141.3
EFTUD2Q15029 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.028e-26■■■■■ 133.2
EFTUD2Q15029 YTHDC1-206ENST00000510746 515 ntTSL 423.12■■□□□ 1.291e-23■■■■■ 131.2
EFTUD2Q15029 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 38.21□□□□□ -1.12e-18■■■■■ 125.6
EFTUD2Q15029 FBL-205ENST00000595545 896 ntTSL 27.76□□□□□ -1.172e-18■■■■■ 125.6
EFTUD2Q15029 RNF5-204ENST00000487940 357 ntTSL 214.85□□□□□ -0.037e-14■■■■■ 125
EFTUD2Q15029 RPL38-205ENST00000530646 2450 ntTSL 1 (best)19.06■□□□□ 0.645e-57■■■■■ 123.9
EFTUD2Q15029 RPL38-203ENST00000528433 169 ntTSL 512.6□□□□□ -0.395e-57■■■■■ 123.9
EFTUD2Q15029 RPL38-204ENST00000529123 576 ntTSL 29.82□□□□□ -0.845e-57■■■■■ 123.9
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-14■■■■■ 119.1
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-14■■■■■ 119.1
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-203ENST00000553585 581 ntTSL 35.22□□□□□ -1.572e-14■■■■■ 119.1
EFTUD2Q15029 SKIV2L-211ENST00000485349 734 ntTSL 215.68■□□□□ 0.14e-85■■■■■ 118.2
EFTUD2Q15029 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.024e-10■■■■■ 117.2
EFTUD2Q15029 GPX3-204ENST00000520059 316 ntTSL 310.87□□□□□ -0.671e-27■■■■■ 116.3
EFTUD2Q15029 ABCC1-205ENST00000574224 1543 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.416e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-205ENST00000599530 730 ntTSL 311.58□□□□□ -0.566e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-207ENST00000600738 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.826e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-203ENST00000596690 564 ntTSL 49.75□□□□□ -0.856e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.956e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-202ENST00000595418 546 ntTSL 59□□□□□ -0.976e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 ZNF649-204ENST00000597882 561 ntTSL 48.15□□□□□ -1.16e-17■■■■■ 115.1
EFTUD2Q15029 RPS6-205ENST00000498815 480 ntTSL 23.73□□□□□ -1.819e-24■■■■■ 114.9
EFTUD2Q15029 KHSRP-202ENST00000594496 999 ntTSL 217.6■□□□□ 0.418e-19■■■■■ 114.4
EFTUD2Q15029 KHSRP-212ENST00000600480 851 ntTSL 215.04■□□□□ -08e-19■■■■■ 114.4
EFTUD2Q15029 KHSRP-203ENST00000594745 379 ntTSL 313.35□□□□□ -0.278e-19■■■■■ 114.4
EFTUD2Q15029 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.517e-13■■■■■ 113.9
EFTUD2Q15029 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.637e-13■■■■■ 113.9
EFTUD2Q15029 RPL38-207ENST00000534490 429 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.817e-13■■■■■ 113.9
EFTUD2Q15029 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.827e-13■■■■■ 113.9
EFTUD2Q15029 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.717e-13■■■■■ 113.9
EFTUD2Q15029 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.451e-27■■■■■ 109.8
EFTUD2Q15029 AKR1A1-206ENST00000475919 630 ntTSL 210.11□□□□□ -0.794e-21■■■■■ 109.6
EFTUD2Q15029 SLC3A2-214ENST00000539507 534 ntTSL 36.17□□□□□ -1.424e-14■■■■■ 103.4
EFTUD2Q15029 TRIM28-214ENST00000600840 338 ntTSL 28.56□□□□□ -1.042e-24■■■■■ 100.8
EFTUD2Q15029 ABCF3-216ENST00000485921 813 ntTSL 223.07■■□□□ 1.281e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 ABCF3-202ENST00000421340 690 ntTSL 221.45■■□□□ 1.021e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 ABCF3-204ENST00000463685 661 ntTSL 214.96□□□□□ -0.011e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-213ENST00000540241 608 ntTSL 312.7□□□□□ -0.381e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 SFXN2-211ENST00000602785 607 ntTSL 512.69□□□□□ -0.381e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 ABCF3-215ENST00000481116 568 ntTSL 412.25□□□□□ -0.451e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 ABCF3-212ENST00000478288 754 ntTSL 312.08□□□□□ -0.481e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 SFXN2-209ENST00000602670 574 ntTSL 411.58□□□□□ -0.561e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 ABCF3-205ENST00000466416 554 ntTSL 48.4□□□□□ -1.061e-14■■■■■ 99.4
EFTUD2Q15029 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.87e-18■■■■■ 98.9
EFTUD2Q15029 SNRPA-211ENST00000601545 695 ntTSL 519.87■□□□□ 0.777e-18■■■■■ 98.9
EFTUD2Q15029 SNRPA-205ENST00000598923 952 ntTSL 217.74■□□□□ 0.437e-18■■■■■ 98.9
EFTUD2Q15029 SNRPA-210ENST00000601393 969 ntTSL 316.08■□□□□ 0.167e-18■■■■■ 98.9
EFTUD2Q15029 TRIM28-213ENST00000598355 714 ntTSL 215.43■□□□□ 0.061e-13■■■■■ 97.8
EFTUD2Q15029 TRIM28-206ENST00000595974 665 ntTSL 315.42■□□□□ 0.061e-13■■■■■ 97.8
EFTUD2Q15029 ABCC10-209ENST00000502549 478 ntTSL 316.29■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 96.8
EFTUD2Q15029 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.021e-13■■■■■ 96.8
EFTUD2Q15029 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.462e-13■■■■■ 96.3
EFTUD2Q15029 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.728e-9■■■■■ 96
EFTUD2Q15029 RPS18-235ENST00000479802 413 ntTSL 210.93□□□□□ -0.664e-24■■■■■ 95
EFTUD2Q15029 RPS18-231ENST00000472218 1109 ntTSL 210.82□□□□□ -0.684e-24■■■■■ 95
EFTUD2Q15029 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 94.9
EFTUD2Q15029 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.88e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.388e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.278e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 TUSC2-205ENST00000462137 834 ntTSL 321.18■□□□□ 0.988e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ELL3-202ENST00000433927 792 ntTSL 518.88■□□□□ 0.618e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ELL3-208ENST00000497700 574 ntTSL 317.4■□□□□ 0.388e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 HYAL2-206ENST00000428028 571 ntTSL 316.62■□□□□ 0.258e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.238e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.188e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ATG16L1-207ENST00000417017 684 ntTSL 515.76■□□□□ 0.118e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ATG16L1-208ENST00000419681 644 ntTSL 515.25■□□□□ 0.038e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ATG16L1-210ENST00000444735 691 ntTSL 515.25■□□□□ 0.038e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ATG16L1-216ENST00000485623 568 ntTSL 214.09□□□□□ -0.158e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 HYAL2-210ENST00000481597 1513 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.218e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ELL3-207ENST00000497530 582 ntTSL 313.07□□□□□ -0.328e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ELL3-204ENST00000476335 452 ntTSL 212.18□□□□□ -0.468e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 AC018512.1-201ENST00000417761 2326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.558e-14■■■■■ 94.2
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