Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHD4Q14839 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHD4Q14839 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHD4Q14839 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHD4Q14839 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHD4Q14839 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHD4Q14839 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHD4Q14839 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHD4Q14839 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHD4Q14839 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHD4Q14839 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHD4Q14839 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHD4Q14839 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHD4Q14839 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHD4Q14839 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHD4Q14839 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHD4Q14839 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHD4Q14839 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHD4Q14839 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHD4Q14839 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CHD4Q14839 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHD4Q14839 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHD4Q14839 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHD4Q14839 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHD4Q14839 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHD4Q14839 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHD4Q14839 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHD4Q14839 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHD4Q14839 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHD4Q14839 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
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CHD4Q14839 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CHD4Q14839 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHD4Q14839 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHD4Q14839 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHD4Q14839 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHD4Q14839 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHD4Q14839 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHD4Q14839 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHD4Q14839 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHD4Q14839 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
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