Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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