Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SF3B2Q13435 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SF3B2Q13435 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SF3B2Q13435 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SF3B2Q13435 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SF3B2Q13435 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SF3B2Q13435 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SF3B2Q13435 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SF3B2Q13435 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SF3B2Q13435 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SF3B2Q13435 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SF3B2Q13435 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SF3B2Q13435 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SF3B2Q13435 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
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