Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSLNQ13421 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSLNQ13421 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSLNQ13421 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSLNQ13421 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
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