Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA3FQ13275 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SEMA3FQ13275 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEMA3FQ13275 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEMA3FQ13275 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEMA3FQ13275 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
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