Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCQQ04759 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCQQ04759 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCQQ04759 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCQQ04759 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCQQ04759 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCQQ04759 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCQQ04759 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCQQ04759 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCQQ04759 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCQQ04759 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCQQ04759 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCQQ04759 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCQQ04759 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCQQ04759 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCQQ04759 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCQQ04759 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCQQ04759 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCQQ04759 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCQQ04759 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCQQ04759 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCQQ04759 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCQQ04759 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms