Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX2Q02962 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAX2Q02962 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX2Q02962 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX2Q02962 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX2Q02962 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms