Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2P78314 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2P78314 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2P78314 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2P78314 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2P78314 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2P78314 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2P78314 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2P78314 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2P78314 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2P78314 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2P78314 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2P78314 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2P78314 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH3BP2P78314 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP2P78314 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.2 ms