Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMP1P54849 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMP1P54849 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMP1P54849 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMP1P54849 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMP1P54849 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMP1P54849 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMP1P54849 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMP1P54849 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMP1P54849 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMP1P54849 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMP1P54849 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EMP1P54849 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMP1P54849 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMP1P54849 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMP1P54849 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMP1P54849 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EMP1P54849 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMP1P54849 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMP1P54849 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMP1P54849 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMP1P54849 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMP1P54849 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMP1P54849 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMP1P54849 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMP1P54849 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EMP1P54849 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMP1P54849 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMP1P54849 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EMP1P54849 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMP1P54849 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMP1P54849 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMP1P54849 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMP1P54849 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMP1P54849 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMP1P54849 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMP1P54849 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMP1P54849 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMP1P54849 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMP1P54849 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMP1P54849 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMP1P54849 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMP1P54849 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMP1P54849 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMP1P54849 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMP1P54849 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMP1P54849 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMP1P54849 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMP1P54849 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMP1P54849 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EMP1P54849 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMP1P54849 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMP1P54849 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMP1P54849 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMP1P54849 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMP1P54849 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMP1P54849 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMP1P54849 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMP1P54849 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMP1P54849 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMP1P54849 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMP1P54849 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMP1P54849 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMP1P54849 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMP1P54849 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMP1P54849 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMP1P54849 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMP1P54849 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMP1P54849 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMP1P54849 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMP1P54849 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMP1P54849 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMP1P54849 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EMP1P54849 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMP1P54849 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMP1P54849 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMP1P54849 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMP1P54849 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMP1P54849 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMP1P54849 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMP1P54849 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMP1P54849 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMP1P54849 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMP1P54849 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMP1P54849 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMP1P54849 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMP1P54849 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMP1P54849 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMP1P54849 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EMP1P54849 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMP1P54849 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMP1P54849 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMP1P54849 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMP1P54849 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMP1P54849 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMP1P54849 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMP1P54849 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMP1P54849 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMP1P54849 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMP1P54849 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms