Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB1P54762 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EPHB1P54762 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB1P54762 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EPHB1P54762 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB1P54762 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.9 ms