Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNPDA1P46926 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPDA1P46926 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNPDA1P46926 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GNPDA1P46926 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GNPDA1P46926 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms