Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN1BP46527 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN1BP46527 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN1BP46527 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms