Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNT3P45378 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNT3P45378 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNT3P45378 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNT3P45378 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNT3P45378 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
TNNT3P45378 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNT3P45378 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNT3P45378 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNT3P45378 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNT3P45378 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNT3P45378 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNT3P45378 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNT3P45378 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNT3P45378 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNT3P45378 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT3P45378 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT3P45378 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT3P45378 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms