Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSFMP43897 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSFMP43897 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSFMP43897 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSFMP43897 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSFMP43897 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSFMP43897 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSFMP43897 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSFMP43897 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSFMP43897 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSFMP43897 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSFMP43897 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSFMP43897 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSFMP43897 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSFMP43897 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSFMP43897 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSFMP43897 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSFMP43897 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSFMP43897 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSFMP43897 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSFMP43897 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSFMP43897 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSFMP43897 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSFMP43897 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSFMP43897 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TSFMP43897 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSFMP43897 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSFMP43897 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSFMP43897 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSFMP43897 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSFMP43897 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSFMP43897 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSFMP43897 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSFMP43897 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSFMP43897 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSFMP43897 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSFMP43897 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSFMP43897 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSFMP43897 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSFMP43897 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSFMP43897 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSFMP43897 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSFMP43897 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSFMP43897 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSFMP43897 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSFMP43897 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSFMP43897 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSFMP43897 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSFMP43897 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSFMP43897 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSFMP43897 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSFMP43897 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSFMP43897 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSFMP43897 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSFMP43897 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSFMP43897 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSFMP43897 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSFMP43897 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSFMP43897 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSFMP43897 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSFMP43897 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSFMP43897 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSFMP43897 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSFMP43897 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSFMP43897 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSFMP43897 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSFMP43897 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSFMP43897 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSFMP43897 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSFMP43897 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSFMP43897 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSFMP43897 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSFMP43897 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSFMP43897 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSFMP43897 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSFMP43897 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSFMP43897 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSFMP43897 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSFMP43897 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSFMP43897 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSFMP43897 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSFMP43897 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSFMP43897 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSFMP43897 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSFMP43897 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSFMP43897 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSFMP43897 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSFMP43897 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TSFMP43897 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSFMP43897 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSFMP43897 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSFMP43897 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSFMP43897 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSFMP43897 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSFMP43897 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSFMP43897 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSFMP43897 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TSFMP43897 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSFMP43897 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TSFMP43897 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms