Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX1P27695 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX1P27695 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX1P27695 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX1P27695 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX1P27695 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX1P27695 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX1P27695 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX1P27695 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX1P27695 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX1P27695 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX1P27695 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX1P27695 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX1P27695 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX1P27695 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX1P27695 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX1P27695 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX1P27695 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APEX1P27695 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APEX1P27695 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX1P27695 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX1P27695 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX1P27695 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX1P27695 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX1P27695 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX1P27695 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX1P27695 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX1P27695 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX1P27695 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX1P27695 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX1P27695 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX1P27695 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX1P27695 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX1P27695 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX1P27695 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX1P27695 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX1P27695 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX1P27695 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX1P27695 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX1P27695 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX1P27695 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX1P27695 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX1P27695 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX1P27695 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX1P27695 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX1P27695 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APEX1P27695 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APEX1P27695 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX1P27695 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX1P27695 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX1P27695 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX1P27695 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX1P27695 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX1P27695 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX1P27695 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX1P27695 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX1P27695 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX1P27695 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX1P27695 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX1P27695 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX1P27695 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX1P27695 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX1P27695 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX1P27695 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX1P27695 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX1P27695 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX1P27695 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX1P27695 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX1P27695 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX1P27695 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX1P27695 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX1P27695 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX1P27695 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX1P27695 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX1P27695 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX1P27695 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX1P27695 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APEX1P27695 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APEX1P27695 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APEX1P27695 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX1P27695 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX1P27695 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX1P27695 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX1P27695 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX1P27695 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX1P27695 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX1P27695 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX1P27695 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX1P27695 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX1P27695 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX1P27695 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX1P27695 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX1P27695 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX1P27695 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX1P27695 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX1P27695 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APEX1P27695 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX1P27695 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APEX1P27695 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX1P27695 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms