Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNCP24863 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNCP24863 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNCP24863 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNCP24863 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNCP24863 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNCP24863 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNCP24863 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNCP24863 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNCP24863 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNCP24863 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNCP24863 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNCP24863 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNCP24863 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNCP24863 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNCP24863 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNCP24863 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNCP24863 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNCP24863 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNCP24863 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNCP24863 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNCP24863 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNCP24863 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNCP24863 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNCP24863 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNCP24863 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNCP24863 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNCP24863 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNCP24863 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNCP24863 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNCP24863 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNCP24863 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNCP24863 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNCP24863 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNCP24863 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNCP24863 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNCP24863 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNCP24863 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNCP24863 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNCP24863 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNCP24863 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNCP24863 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNCP24863 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNCP24863 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNCP24863 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNCP24863 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNCP24863 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNCP24863 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNCP24863 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNCP24863 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNCP24863 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNCP24863 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNCP24863 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNCP24863 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNCP24863 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNCP24863 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNCP24863 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNCP24863 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNCP24863 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNCP24863 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNCP24863 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNCP24863 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNCP24863 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNCP24863 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNCP24863 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNCP24863 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNCP24863 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNCP24863 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNCP24863 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNCP24863 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNCP24863 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNCP24863 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNCP24863 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNCP24863 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNCP24863 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNCP24863 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNCP24863 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNCP24863 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNCP24863 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNCP24863 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNCP24863 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNCP24863 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNCP24863 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNCP24863 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNCP24863 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNCP24863 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNCP24863 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNCP24863 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNCP24863 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNCP24863 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNCP24863 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNCP24863 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNCP24863 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNCP24863 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNCP24863 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNCP24863 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNCP24863 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNCP24863 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNCP24863 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNCP24863 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms