Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAPN2P17655 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAPN2P17655 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPN2P17655 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPN2P17655 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPN2P17655 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPN2P17655 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPN2P17655 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPN2P17655 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAPN2P17655 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAPN2P17655 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPN2P17655 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPN2P17655 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAPN2P17655 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAPN2P17655 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CAPN2P17655 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAPN2P17655 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CAPN2P17655 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAPN2P17655 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAPN2P17655 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CAPN2P17655 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAPN2P17655 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPN2P17655 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPN2P17655 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPN2P17655 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAPN2P17655 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAPN2P17655 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAPN2P17655 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAPN2P17655 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms