Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H2AFXP16104 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H2AFXP16104 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H2AFXP16104 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H2AFXP16104 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H2AFXP16104 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H2AFXP16104 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
H2AFXP16104 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H2AFXP16104 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
H2AFXP16104 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H2AFXP16104 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H2AFXP16104 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
H2AFXP16104 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
H2AFXP16104 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H2AFXP16104 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H2AFXP16104 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H2AFXP16104 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
H2AFXP16104 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H2AFXP16104 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H2AFXP16104 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H2AFXP16104 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H2AFXP16104 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.53■■■□□ 2
H2AFXP16104 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H2AFXP16104 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
H2AFXP16104 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
H2AFXP16104 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
H2AFXP16104 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
H2AFXP16104 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H2AFXP16104 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms