Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF35P13682 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF35P13682 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF35P13682 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF35P13682 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF35P13682 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms